enseñar a mi perra a ir al baño

Hola, queria saber si me pueden ayudar en lo siguiente.adopte una perra ya como dos semanas y se estaba haciendo pipi y popo dentro de la casa como 3 veces al dia , he estado sacandola al patio constantemente para que haga pipi y hace, hasta ha dejado de hacerse pipi en casa, pero mi pregunta es la siguiente: cómo le enseño a que vaya por su cuenta , si no la llevo , no sale y se hace dentro. Tenemos en la puerta que da al patio la ventanilla que usan los perros para salir , mi otra perra ya la sabe usar y sale cuando quiere, pero no logro que salga por ahi, solo sale cuando salgo yo , y eso a veces no quiere . se que lleva poco conmigo para entender, pero quiero empezar de temprano a que sepa ir al baño, ya que trabajo casi todo el dia y no me gustaria ver las sorpresas, funcionaria en este caso el famoso " clicker " que dicen ke es practico y eficiente.Gracias